Leon's Blog

生命可以归结为一种简单的选择,要么忙于生存,要么赶着去死


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全局序列比对

发表于 2019-03-25 |
字数统计: 318 | 阅读时长 ≈ 1
Needleman–Wunsch algorithm序列比对是生物信息中常见的问题,算法有全局比对 Needleman-Wunsch和Smith-Waterman局部比对算法,两者非常相似,区别只是打分矩阵的差异。这里只以简单的双序列全局比对作为引子,具体描述可以参考维基百科(https://en. ...
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consensus sequence

发表于 2019-03-07 |
字数统计: 466 | 阅读时长 ≈ 1
怎么获得共有序列(consensus sequence)在网上大家会反复提到的一个问题是“我怎么从我的bam文件中获得共有序列(consensus)”,这个问题的翻版是“我怎么从我的bam文件中提取fasta序列”。当然,这个问题背后实际想表达的通常是获得样品中感兴趣区间的序列,然后进行多样本或多物 ...
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Y-Haplo

发表于 2019-03-06 |
字数统计: 354 | 阅读时长 ≈ 2
YpredictYpredict is a python based software package that predicts y chromosome haplogroup. Here, I use calculate rank method to automatically find the ...
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hexo

发表于 2019-03-06 |
字数统计: 80 | 阅读时长 ≈ 1
HEXOstep1hexo init mybloghexo new ‘firstblog’hexo ghexo d step2部署:修改站点配置文件:deploy: type: git repository: github@github.com:N-damo.github.io.git b ...
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Li'an Lin

Li'an Lin

记录生命美好时刻,公众号"Ypredict"

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